Biochemical characterization for determination of genetic distances among different indigenous chickpea (Cicer arietinum L. ) varieties of North-West Pakistan / Caracterização bioquímica para determinação de distâncias genéticas entre diferentes variedades indígenas de grão-de-bico (Cicer arietinum L. ) do noroeste do Paquistão

Abstract Genetic distances among different chickpea varieties and evaluation of their free amino acid profiles were determined on the basis of Sodium dodecyle sulphate polyacrylamide gels electrophoresis (SDS-PAGE). Total soluble proteins were resolved on 10% SDS Polyacrylamide gel. Low variability in tested varieties was observed. Dendogram based on electrophoretic data clustered the genotypes into 2 groups. The results showed that the average protein content of all the varieties was 26.01% within the range 22.8% for Thal-2006 to 34.06% Sheenghar-2000 of dry seed weight. On the basis of total protein content Bittal-98, Dasht and Sheen Ghar-2000, Karak-3 and CM-98, Paidar -91 and Fakhr-e-Thal, C-44, Balaksar and KK-1showed similar concentrations for protein contents among each other but showed variation from the rest of the varieties. Different proteins were separated on the basis of changes in their molecular weights by means of Sodium Dodecyl Sulphate Polyacrylamide Gel Electrophoresis (SDS-PAGE). Dasht, CM-98, and Sheen Ghar showed 100% similarity. Balaksar and Fakhr-e- Thal, KK-2 and Chattan and KC-98, KK-1 and Lawaghar were 100% similar among each other but showed variation from the rest of the accessions. The overall dendrogram showed high and low level of variation among the accessions. The concentration of free amino acids varied among the 16 chickpea varieties. A significant difference of both essential and non-essential amino acids was found among the chickpea cultivars. The total concentration of essential amino acid was recorded 40.81 g/100 g protein while non-essential was recorded 59.18343 g/100 g protein in the given cultivars. The highest concentration of essential amino acids was found in C-44 followed by KK-2, KK-1 and Fakhr E Tal while the lowest concentration was recorded in Cm-98, Paidar-91 and Sheen Ghar-2000 respectively. Cultivars TAL-2006, Chattan and Karak-3 showed maximum concentration of both essential and endogenous amino acids. In conclusion; for broadening the genetic pools in breeding programs or to search for exotic characters, for instance new disease resistance alleles, accession with low similarity coefficients (Lawaghar and Battal-98) may be utilized. Furthermore the information acquired from this study could be used to device a proficient breeding approach intended at improving nutritional as well as broadening the genetic base of this essential food crop of Pakistan.

Resumo As distâncias genéticas entre as diferentes variedades de grão-de-bico e a avaliação de seus perfis de aminoácidos livres foram determinadas com base na eletroforese em gel de poliacrilamida com dodecil sulfato de sódio (SDS-PAGE). As proteínas solúveis totais foram resolvidas em SDS-PAGE a 10%. Foi observada baixa variabilidade nas variedades testadas. O dendrograma fundamentado em dados eletroforéticos agrupou os genótipos em dois grupos. Os resultados mostraram que o teor médio de proteínas de todas as variedades foi de 26,01%, na faixa de 22,8% para Thal-2006 a 34,06% para Sheenghar-2000 do peso de sementes secas. Com base no conteúdo total de proteínas, Bittal-98, Dasht, Sheen Ghar-2000, Karak-3, CM-98, Paidar-91, Fakhr-e-Thal, C-44, Balaksar e KK-1 apresentaram concentrações semelhantes para o conteúdo de proteínas entre si, mas tiveram variação quanto ao restante das variedades. Diferentes proteínas foram separadas com base nas alterações de seus pesos moleculares por meio de eletroforese em gel de poliacrilamida com dodecil sulfato de sódio (SDS-PAGE). Dasht, CM-98 e Sheen Ghar mostraram 100% de similaridade. Balaksar, Fakhr-e-Thal, KK-2, Chattan e KC-98, KK-1 e Lawaghar foram 100% semelhantes entre si, mas apresentaram variação em relação ao restante dos acessos. O dendrograma geral mostrou alto e baixo nível de variação entre os acessos. A concentração de aminoácidos livres variou entre as 16 variedades de grão-de-bico. Foi encontrada uma diferença significativa entre os aminoácidos essenciais e não essenciais nas cultivares de grão-de-bico. A concentração total de aminoácidos essenciais foi registrada em 40,81 g / 100 g de proteína, enquanto a não essencial foi registrada em 59,18343 g / 100 g de proteína nas cultivares. A maior concentração de aminoácidos essenciais foi encontrada em C-44, seguida de KK-2, KK-1 e Fakhr-e-Thal, enquanto a menor concentração foi registrada em CM-98, Paidar-91 e Sheen Ghar-2000. As cultivares TAL-2006, Chattan e Karak-3 apresentaram concentração máxima de aminoácidos essenciais e endógenos. Em conclusão, para ampliar os pools genéticos em programas de melhoramento ou procurar caracteres exóticos, por exemplo, novos alelos de resistência a doenças, pode ser utilizada a adesão com baixos coeficientes de similaridade (Lawaghar e Battal-98). Além disso, as informações adquiridas neste estudo poderiam ser usadas para criar uma abordagem de criação eficiente, com o objetivo de melhorar a nutrição e ampliar a base genética dessa cultura alimentar essencial do Paquistão.

Soybean productivity, stability, and adaptability through mixed model methodology / Produtividade, estabilidade e adaptabilidade da soja por meio de metodologia de modelo misto

ABSTRACT: The genotype × environment (G×E) interaction plays an essential role in phenotypic expression and can lead to difficulties in genetic selection. Thus, the present study aimed to estimate genetic parameters and to compare different selection strategies in the context of mixed models for soybean breeding. For this, data referring to the evaluation of 30 genotypes in 10 environments, regarding the grain yield trait, were used. The variance components were estimated through restricted maximum likelihood (REML) and genotypic values were predicted through best linear unbiased prediction (BLUP). Significant effects of genotypes and G×E interaction were detected by the likelihood ratio test (LRT). Low genotypic correlation was obtained across environments, indicating complex G×E interaction. The selective accuracy was very high, indicating high reliability. Our results showed that the most productive soybean genotypes have high adaptability and stability.

RESUMO: A interação genótipo × ambiente (G × E) desempenha um papel essencial na expressão fenotípica e pode provocar dificuldades na seleção genética. Assim, o presente estudo teve como objetivo estimar parâmetros genéticos e comparar diferentes estratégias de seleção no contexto de modelos mistos para melhoramento da soja. Para isso, foram utilizados dados referentes à avaliação de 30 genótipos em dez ambientes, referentes à característica produtividade de grãos. Os componentes de variância foram estimados pela máxima verossimilhança restrita (REML) e os valores genotípicos foram preditos pela melhor previsão imparcial linear (BLUP). Efeitos significativos dos genótipos e interação G × E foram detectados pelo teste da razão de verossimilhança (LRT). Correlação genotípica baixa foi obtida entre os ambientes indicando interação G × E do tipo complexa. A acurácia seletiva foi muito alta, indicando alta confiabilidade. Os resultados mostraram que os genótipos de soja mais produtivos apresentam alta adaptabilidade e estabilidade.

Phenotypic adaptability of cotton genotypes to the brazilian cerrado for yield and fiber quality / Adaptabilidade fenotípica de genótipos de algodão ao cerrado brasileiro para produtividade e qualidade de fibras

Studies on the adaptability and stability are fundamental for plant breeding as they are an alternative to reduce the effects of genotypes x environments interaction (GxE). Moreover, they help identify cultivars with predictable behavior, which are responsive to environmental improvements, subsidizing cultivar recommendation. This study aimed to evaluate the genotypes x environments interaction in cotton genotypes grown in the Brazilian Cerrado and identify genotypes for favorable and unfavorable environments. During the 2013/2014 and 2014/2015 seasons, 19 competition trials were carried out with cotton in a randomized block design, with 12 treatments, and four replications. The traits cotton seed yield, fiber percentage, fiber length, and fiber strength were evaluated. Results revealed significant GxE interaction for all the fiber traits evaluated. Genotype BRS 369 RF revealed general adaptability and high predictability for the fiber traits evaluated.

Estudos sobre a adaptabilidade e estabilidade são fundamentais para o melhoramento de plantas, pois são considerados uma alternativa para reduzir os efeitos da interação genótipos x ambientes (GxE) e identificar cultivares com comportamento previsível e responsivo a melhorias ambientais, subsidiando a recomendação de cultivares. Este trabalho teve como objetivo investigar a interação genótipos x ambientes em genótipos de algodoeiro cultivados no Cerrado brasileiro e identificar genótipos para ambientes favoráveis e desfavoráveis. Durante as safras 2013/2014 e 2014/2015, foram realizados 19 ensaios de competição com algodão em delineamento de blocos ao acaso, com 12 tratamentos e quatro repetições. As características produtividade de sementes de algodão, porcentagem de fibras, comprimento de fibra e resistência das fibras foram avaliadas. Os resultados revelaram interação significativa da GxE para todas as características da fibra avaliada. O genótipo BRS 369 RF revelou adaptabilidade geral e alta previsibilidade para as características da fibra avaliada.

Selection of sugarcane families and clones under cold stress / Seleção de famílias e clones de cana-de-açúcar sob estresse pelo frio

ABSTRACT: The purpose of this study was to select cold-tolerant sugarcane families and clones. Evaluations were carried out during three selection phases in the municipality of Pelotas, state of Rio Grande do Sul, Brazil. The experiments were arranged in an incomplete block design, with initially 4,452 seedlings of 53 full-sib families. Aside from the traits soluble solids content (BRX), tons of stalks per hectare (TSH) and tons of brixper hectare (TBH), the survival of the apical bud (ABS) was evaluated in the first selection stage (T1) of the breeding program. At the end of three selection phases, 15 clones of 14 of the 53 families evaluated in the first phase (T1) were selected for the experimental phase. Of these, the clones RS/PR126066, RS/PR126044, RS/PR126052, RS/PR126007 and RS/PR126033, had a good performance for apical bud survival in the first selection phase.

RESUMO: O objetivo desse trabalho foi selecionar famílias e clones de cana-de-açúcar tolerantes ao estresse por frio. As avaliações ocorreram durante três fases de seleção no município de Pelotas, no estado do Rio Grande do Sul, Brasil. Os experimentos foram conduzidos no delineamento de blocos incompletos, sendo inicialmente composto por 4.452 seedlings oriundos de 53 famílias de irmãos completos. Além dos caracteres teor de sólidos solúveis (BRIX), tonelada de colmos por hectare (TCH) e tonelada de brix por hectare (TBH), foi avaliada a sobrevivência do meristema apical (GEM) na primeira fase de seleção (T1) do programa de melhoramento genético. Ao final de três fases de seleção, 15 clones pertencentes a 14 das 53 famílias avaliadas na primeira fase (T1) foram selecionados para a fase de experimentação, destes, destacam-se: RS/PR126066, RS/PR126044, RS/PR126052, RS/PR126007 e RS/PR126033, pois além de apresentar desempenho satisfatório para os caracteres TCH e TBH, foram avaliados com notas máximas (N4 e N5) para sobrevivência de gema apical no primeiro ciclo de seleção.

Indirect response in genome wide selection using selected markers / Resposta indireta na seleção genômica ampla usando seleção de marcadores

The goal of this work was to compare the effect of the accuracy and residual variance in genome wide selection using marker selection as well as using the effect of the indirect selection, using simulated and real data. In simulated data was used one sample with 200 individuals with 1,000 molecular markers in F2 population. The real data was obtained in maize with F2 population with 441 individuals and genotyping with 261 SSR markers. There was 11 traits evaluated (ear length, ear width, row number, kernels per row, 100-kernel weight, ear weight, grain yield, length of branch, number of branch, plant height and ear height). All data was analyzed using rrBLUP method and 10-fold cross-validation. In simulated and maize data the results were similar: the residual variance with few markers is lower than with the 1000 markers and the accuracy with few markers is bigger than with 1000 markers. For maize data multi trait selection, the accuracy increased when the correlation between traits is greater than 0.50 and residual variance decreased when the correlation is greater than 0.70. In this sense, these results showed that marker selection could be used as a first step in genome wide selection, improving the prediction and compute demand.

O objetivo deste trabalho foi comparar o efeito da precisão e da variância residual na seleção genômica ampla utilizando a seleção de marcadores, bem como utilizando o efeito da seleção indireta, utilizando dados simulados e reais. Foram usados simulados de uma amostra com 200 indivíduos com 1.000marcadores moleculares na população F2. Os dados reais foram obtidos em milho com população F2 com 441indivíduos e genotipagem com 261 marcadores SSR. Foram avaliados 11 caracteres (comprimento da espiga,largura da espiga, número da linha, grãos por linha, peso de 100 grãos, peso da espiga, produtividade de grãos, comprimento da espiga, número de espigas, altura da planta e altura da espiga). Todos os dados foram analisados usando o método rrBLUP, sendo realizada 10 vezes a validação cruzada. Em dados simulados e de milho, os resultados foram semelhantes: a variância residual com poucos marcadores é menor do que com os marcadores 1000 e a precisão com poucos marcadores é maior do que com os marcadores 1000. Para a seleção multi-característica dos dados do milho, a precisão aumentou quando a correlação entre as características é maior que 0,50 e a variância residual diminuiu quando a correlação é maior que 0,70. Nesse sentido, esses resultados mostraram que a seleção de marcadores poderia ser usada como um primeiro passo na seleção genômica ampla, melhorando a previsão e a demanda computacional.

Genetic diversity among soursop genotypes based on fruit production / Diversidade genética entre genótipos de graviola baseada na produtividade de frutos

This study aimed to estimate the genetic diversity among soursop genotypes in terms of fruit yield evaluated in different crop years. Sixteen measurements for fruit yield in 71 soursop genotypes were carried out from 2000 to 2016. Based on ANOVA it was verified the existence of genetic variability among genotypes in the different measurements (harvests). The genotypes were clustered according to their respective fruit yield averages in the 16 years as well as from their means obtained in each measurement year by the Scott-Knott test (p<0.05). To study genetic diversity among genotypes, three methodologies were compared: Tocher hierarchical optimization, UPGMA method and principal components. Five groups were formed for all clustering methods used. It was identified that crossings between genotypes 124 and 145 with genotypes 59 and 170 are potential to generate population with large genetic variability and high fruit yield average. New researches should be developed aiming to exploit the genetic variability among soursop genotypes based on the results found in this study.

O objetivo deste estudo foi estimar a diversidade genética entre genótipos de graviola em termos de produção de frutos avaliados em diferentes safras. Foram realizadas 16 medições de rendimento de frutos em 71 genótipos de graviola no período de 2000 a 2016. Com base na ANOVA, verificou-se a existência de variabilidade genética entre genótipos nas diferentes medidas (colheitas). Os genótipos foram agrupados de acordo com suas respectivas médias de rendimento de frutos nos 16 anos, bem como suas médias obtidas em cada ano de medição pelo agrupamento de médias de Scott-Knott. Para estudar a diversidade genética entre genótipos, foram aplicados a otimização hierárquica Tocher, método UPGMA e componentes principais. Cinco grupos foram formados para todos os métodos de agrupamento utilizados. Foi identificado que os cruzamentos entre os genótipos 124 e 145 com os genótipos 59 e 170 são promissores para gerar população com grande variabilidade genética e alta média de produtividade de frutos. Novas pesquisas devem ser desenvolvidas com o objetivo de explorar a variabilidade genética entre os genótipos de graviola, com base nos resultados encontrados neste estudo.

Genetic divergence of strawberry cultivars under different managements / Divergência genética de cultivares de morango em diferentes manejos

Developing strawberry cultivars that can be grown on a large scale, it is necessary to gather desirable characteristics such as: tolerance to Tetranychus urticae, high fruit yield and wide adaptability to several cropping managements. Therefore, our objective was to study the genetic diversity among 13 strawberry cultivars under different managements and to recommend promising crosses to obtain segreganting populations with high fruit yield and T. urticae tolerance. Trial was performed under field conditions at the Centro Regional de Desenvolvimento Rural Centro Serrano of the Instituto Capixaba for Technical Assistance and Rural Extension (Incaper), Domingos Martins-ES. We evaluated strawberry cultivars Albion, Aleluia, Aromas, Camarosa, Camino Real, Campinas, Diamante, Dover, Festival, Seascape, Toyonoka, Tudla, and Ventana, cultivated in three cropping managements: open field, low tunnel and high tunnel. Experimental design was randomized complete blocks with three replications. Variables evaluated were: number of two-spotted spider mite/cm2 on the leaf (NTSSM), total number of fruits (TNF), number of commercial fruits (NCF) and fruit yield (YIE, t/ha). We applied the generalized Mahalanobis distance and Tocher's optimization method to study the genetic diversity among cultivars in each management, and the relative contribution of traits to genetic diversity was evaluated according to the criterion described by Singh (1981). For the low tunnel and high tunnel environments, the crosses Aleluia x Camarosa, Aleluia x Aromas and Aleluia x Festival are the most promising to generate segregating populations with a higher possibility to appearance transgressive individuals, while for the open field cultivation system, we recommend the cross among Aleluia x Toynoka. The variables that most contributed for genetic dissimilarity were total number of fruits, fruit yield and number of commercial fruits for the environments open field, low tunnel and high tunnel, respectively.

´Para desenvolver cultivares de morango que podem ser cultivados em larga escala é necessário reunir características desejáveis como: tolerância ao Tetranychus urticae, alta produtividade de frutos e ampla adaptabilidade a diversos sistemas de cultivo. Portanto, o objetivo do trabalho foi estuda a diversidade genética entre 13 cultivares de morango sob diferentes manejos e recomendar cruzamentos promissores para obtenção de populações segregantes com alta produtividade de frutos e tolerantes ao T. urticae. O experimento foi conduzido sob condições de campo no Centro Regional de Desenvolvimento Rural Centro Serrano do Instituto Capixaba de Assistência Técnica e Extenção Rural (Incaper), Domingos Martins-ES, no mês de outubro (primavera). Foram avaliadas as cultivares Albion, Aleluia, Aromas, Camarosa, Camino Real, Campinas, Diamante, Dover, Festival, Seascape, Toyonoka, Tudla e Ventana, cultivadas em três sistemas de cultivo: campo aberto, túnel baixo e túnel alto. O delineamento experimental utilizado foi blocos casualizados com três repetições. As variáveis avaliadas foram: número de ácaro/cm² na folha (NTSSM), número total de frutos (TNF), número de frutos comerciais (NCF) e produtividade de frutos (YIE, t/ha). Foram empregadas a distância generalizada de Mahalanobis e o método de otimização de Tocher para o estudo da diversidade genética entre os cultivares em cada manejo, e a contribuição relativa dos caracteres para a diversidade genética foi avaliada segundo o critério de Singh (1981). Para os manejos túnel baixo e túnel alto, os cruzamentos entre os cultivares Aleluia x Camarosa, Aleluia x Aromas e Aleluia x Festival são os mais promissores para gerar populações segregantes com alta possibilidade de aparecimento de indivíduos transgressivos, enquanto que para o campo aberto recomenda-se o cruzamento entre os cultivares Aleluia x Toynoka. As variáveis que mais contribuíram para a dissimilaridade genética foram o número total de frutos, produtividade e número de frutos comerciais para os ambientes campo aberto, túnel baixo e túnel alto, respectivamente.

Popcorn genotypes resistance to fall armyworm / Genótipos de milho pipoca resistentes à lagarta-do-cartucho

ABSTRACT: The aim of this study was to evaluate popcorn genotypes for resistance to the fall armyworm, Spodoptera frugiperda. The experiment used a completely randomized design with 30 replicates. The popcorn genotypes Aelton, Arzm 05 083, Beija-Flor, Colombiana, Composto Chico, Composto Gaúcha, Márcia, Mateus, Ufvm Barão Viçosa, Vanin, and Viviane were evaluated,along with the common maize variety Zapalote Chico. Newly hatched fall armyworm larvae were individually assessed with regard to biological development and consumption of food. The data were subjected to multivariate analyses of variance and genetic divergence among genotypes was evaluated through the clustering methods of Tocher based on generalized Mahalanobis distances and canonical variable analyses. Seven popcorn genotypes, namely, Aelton, Arzm 05 083, Composto Chico, Composto Gaúcha, Márcia, Mateus, and Viviane,were shown to form a cluster (cluster I) that had antibiosis as the mechanism of resistance to the pest. Cluster I genotypes and the Zapalote Chico genotype could be used for stacking genes for antibiosis and non-preference resistance.

RESUMO: O objetivo do estudo foi avaliar genótipos de milho pipoca para resistência à lagarta-do-cartucho, Spodoptera frugiperda. O experimento foi conduzido em delineamento inteiramente casualizado com 30 repetições. Foram avaliados os genótipos de milho pipoca Aelton, Arzm 05 083, Beija-Flor, Colombiana, Composto Chico, Composto Gaúcha, Márcia, Mateus, Ufvm Barão Viçosa, Vanin, Viviane e Zapalote Chico. Larvas recém-eclodidas foram individualizadas para avaliação do desenvolvimento biológico e consumo alimentar. Os dados foram submetidos à análise multivariada de variância e a divergência genética entre genótipos foi avaliada através dos métodos de agrupamento de Tocher, com base na distância generalizada de Mahalanobis e análise de variáveis canônicas. Sete genótipos,Aelton, Arzm 05 083, Composto Chico, CompostoGaúcha, Márcia, Mateus e Viviane formaram um cluster (cluster I) que apresentaram antibiose com o mecanismo de resistência à praga. Os genótipos do cluster I e Zapalote Chico podem ser usados para empilhar genes para resistência por antibiose e não-preferência.

Phenotypic and genotypic characterization and compatibility among genotypes to select elite clones of cupuassu / Caracterização fenotípica, genotípica e compatibilidade entre genótipos para seleção de clones elite de cupuaçuzeiro

ABSTRACT The expansion of the genetic base of cultivated materials is an ongoing activity of the cupuassu (Theobroma grandiflorum) breeding program. However, the parents involved need to be genotypically and phenotypically characterized to ensure compatibility of crossings, as well as to assist in the selection of more promising individuals for hybridization. This study aimed to identify and select T. grandiflorum clones that are compatible and genetically divergent using tools such as the estimates of genotypic, phenotypic, and combined distances, as well as the compatibility rates among clones. The genetic distance analysis of the clones was performed with 14 heterologous microsatellite primers of cocoa (Theobroma cacao) that amplify the DNA of cupuassu. Phenotypic characterization was based on 14 variables related to fruit production. The joint dissimilarity matrix was obtained by means of the sum of the phenotypic and molecular dissimilarity matrices. The intra- and inter-clonal compatibility was estimated through controlled crossings. A low correlation was noted between the dissimilarity matrices based on the molecular and agronomic data. As for compatibility, all clones were self-incompatible, with different compatibility rates when crossed. The compatibility index was strongly influenced by the degree of relationship of the clones. It was possible to identify and select the most promising sets of cupuassu clones to be used in breeding programs, despite their genetic relationship.

RESUMO A ampliação da base genética dos materiais de cultivo é trabalho contínuo do programa de melhoramento genético do cupuaçuzeiro (Theobroma grandiflorum). Há necessidade, entretanto, que os parentais envolvidos estejam caracterizados fenotípica e genotipicamente, para auxiliar na escolha dos indivíduos que serão hibridizados, bem como para garantir os mecanismos de rastreabilidade e proteção das cultivares. Este estudo teve como objetivo identificar e selecionar clones de cupuaçuzeiro inter-compatíveis e geneticamente divergentes, utilizando como ferramentas as distâncias genotípica, fenotípica e combinada mistas, assim como as taxas de compatibilidade entre os clones. Estimativas das distâncias genéticas entre os clones foram realizadas com base em 14 iniciadores microssatélites heterólogos de cacaueiro (Theobroma cacao) que amplificam o DNA do cupuaçuzeiro. Para a caracterização fenotípica foram empregadas 14 variáveis ​​relacionadas à produção de frutos. A matriz de dissimilaridade conjunta foi obtida por meio da soma das matrizes de dissimilaridade fenotípica e molecular. A compatibilidade intra e inter-clonal foi estimada através de cruzamentos controlados. Houve uma baixa correlação entre as matrizes de dissimilaridade com base nos dados moleculares e agronômicos. Quanto à compatibilidade, todos os clones foram auto-incompatíveis, contudo, compatíveis entre si, com diferentes taxas. O índice de compatibilidade foi fortemente influenciado pelo grau de relacionamento dos clones. Foi possível identificar e selecionar os conjuntos de clones de cupuaçuzeiro mais promissores para ser usados em melhoramento genético, apesar da ocorrência de relação genética entre eles.

Genetic parameters of resistance to Meloidogyne incognita in melon / Parâmetros genéticos da resistência a Meloidogyne incognita em meloeiro

ABSTRACT: In order to assess the genetic control of resistance in the melon ‘Gaúcho Redondo’ to the root-knot nematode Meloidogyne incognita, an experiment was conducted in a randomized complete block design with three blocks and six treatments using the parental lines ‘Gaúcho Redondo’ (P1 resistant) and JAB 20 (P2 susceptible), as well as F1, F2, and backcross generations (RC1P1 and RC1P2). Seventy days after inoculation, individual plants were evaluated for resistance using the nematode reproduction factor (RF). The hypothesis of monogenic inheritance was rejected by the chi-square test (χ2), and results indicated that resistance is controlled by more than one gene locus, as confirmed by the quantitative analysis that revealed the presence of six genes.

RESUMO: Com o objetivo de avaliar o controle genético da resistência do melão ‘Gaúcho Redondo’ ao nematoide de galha Meloidogyne incognita, foi conduzido um experimento em blocos casualizados com três blocos e seis tratamentos, os quais envolveram as linhas parentais ‘Gaúcho Redondo’ (P1, resistente) e JAB 20 (P2, suscetível), assim como as gerações F1, F2, e retrocruzamentos (RC1P1 e RC1P2). Avaliaram-se plantas individuais após 70 dias da inoculação com o patógeno, por meio do fator de reprodução do nematoide (FR). A hipótese de herança monogênica foi rejeitada pelo teste do qui-quadrado (χ2), indicando que a resistência está sob controle de mais de um loci gênico, sendo confirmado pela análise quantitativa, que evidenciou a presença de seis genes.

Biochemical characterization for determination of genetic distances among different indigenous chickpea (Cicer arietinum L.) varieties of North-West Pakistan

Abstract Genetic distances among different chickpea varieties and evaluation of their free amino acid profiles were determined on the basis of Sodium dodecyle sulphate polyacrylamide gels electrophoresis (SDS-PAGE). Total soluble proteins were resolved on 10% SDS Polyacrylamide gel. Low variability in tested varieties was observed. Dendogram based on electrophoretic data clustered the genotypes into 2 groups. The results showed that the average protein content of all the varieties was 26.01% within the range 22.8% for Thal-2006 to 34.06% Sheenghar-2000 of dry seed weight. On the basis of total protein content Bittal-98, Dasht and Sheen Ghar-2000, Karak-3 and CM-98, Paidar -91 and Fakhr-e-Thal, C-44, Balaksar and KK-1showed similar concentrations for protein contents among each other but showed variation from the rest of the varieties. Different proteins were separated on the basis of changes in their molecular weights by means of Sodium Dodecyl Sulphate Polyacrylamide Gel Electrophoresis (SDS-PAGE). Dasht, CM-98, and Sheen Ghar showed 100% similarity. Balaksar and Fakhr-e- Thal, KK-2 and Chattan and KC-98, KK-1 and Lawaghar were 100% similar among each other but showed variation from the rest of the accessions. The overall dendrogram showed high and low level of variation among the accessions. The concentration of free amino acids varied among the 16 chickpea varieties. A significant difference of both essential and non-essential amino acids was found among the chickpea cultivars. The total concentration of essential amino acid was recorded 40.81 g/100 g protein while non-essential was recorded 59.18343 g/100 g protein in the given cultivars. The highest concentration of essential amino acids was found in C-44 followed by KK-2, KK-1 and Fakhr E Tal while the lowest concentration was recorded in Cm-98, Paidar-91 and Sheen Ghar-2000 respectively. Cultivars TAL-2006, Chattan and Karak-3 showed maximum concentration of both essential and endogenous amino acids. In conclusion; for broadening the genetic pools in breeding programs or to search for exotic characters, for instance new disease resistance alleles, accession with low similarity coefficients (Lawaghar and Battal-98) may be utilized. Furthermore the information acquired from this study could be used to device a proficient breeding approach intended at improving nutritional as well as broadening the genetic base of this essential food crop of Pakistan.

Resumo As distâncias genéticas entre as diferentes variedades de grão-de-bico e a avaliação de seus perfis de aminoácidos livres foram determinadas com base na eletroforese em gel de poliacrilamida com dodecil sulfato de sódio (SDS-PAGE). As proteínas solúveis totais foram resolvidas em SDS-PAGE a 10%. Foi observada baixa variabilidade nas variedades testadas. O dendrograma fundamentado em dados eletroforéticos agrupou os genótipos em dois grupos. Os resultados mostraram que o teor médio de proteínas de todas as variedades foi de 26,01%, na faixa de 22,8% para Thal-2006 a 34,06% para Sheenghar-2000 do peso de sementes secas. Com base no conteúdo total de proteínas, Bittal-98, Dasht, Sheen Ghar-2000, Karak-3, CM-98, Paidar-91, Fakhr-e-Thal, C-44, Balaksar e KK-1 apresentaram concentrações semelhantes para o conteúdo de proteínas entre si, mas tiveram variação quanto ao restante das variedades. Diferentes proteínas foram separadas com base nas alterações de seus pesos moleculares por meio de eletroforese em gel de poliacrilamida com dodecil sulfato de sódio (SDS-PAGE). Dasht, CM-98 e Sheen Ghar mostraram 100% de similaridade. Balaksar, Fakhr-e-Thal, KK-2, Chattan e KC-98, KK-1 e Lawaghar foram 100% semelhantes entre si, mas apresentaram variação em relação ao restante dos acessos. O dendrograma geral mostrou alto e baixo nível de variação entre os acessos. A concentração de aminoácidos livres variou entre as 16 variedades de grão-de-bico. Foi encontrada uma diferença significativa entre os aminoácidos essenciais e não essenciais nas cultivares de grão-de-bico. A concentração total de aminoácidos essenciais foi registrada em 40,81 g / 100 g de proteína, enquanto a não essencial foi registrada em 59,18343 g / 100 g de proteína nas cultivares. A maior concentração de aminoácidos essenciais foi encontrada em C-44, seguida de KK-2, KK-1 e Fakhr-e-Thal, enquanto a menor concentração foi registrada em CM-98, Paidar-91 e Sheen Ghar-2000. As cultivares TAL-2006, Chattan e Karak-3 apresentaram concentração máxima de aminoácidos essenciais e endógenos. Em conclusão, para ampliar os pools genéticos em programas de melhoramento ou procurar caracteres exóticos, por exemplo, novos alelos de resistência a doenças, pode ser utilizada a adesão com baixos coeficientes de similaridade (Lawaghar e Battal-98). Além disso, as informações adquiridas neste estudo poderiam ser usadas para criar uma abordagem de criação eficiente, com o objetivo de melhorar a nutrição e ampliar a base genética dessa cultura alimentar essencial do Paquistão.

Repeatability of biometric characteristics of Juçara palm fruit / Repetibilidade de características biométricas de frutos de palmito Juçara

Juçara is a plant that occurs in the Brazilian Atlantic Forest which presents high ecological importance to the biodiversity and is present on the list of endangered species. The fruits are known as super fruits because they present chemical characteristics of great importance. Due to its elevated economic importance and for the low number of researches with this species, the first step is to make the pre-breeding of the species. This consists in morphological characterization, which is very dependent on time and labour. Thus, the decrease of the number of evaluated measurements by individual is of great importance to the phases of pre-breeding and breeding. The objective of this work was to obtain estimates of the coefficients of repeatability and determination of six Euterpe edulis fruit characteristics to enable the prediction of the necessary number of measurements required to achieve given levels of certainty for the real values for each of the six fruit characteristics. The performances of various methods for repeatability estimation were compared. The characteristics longitudinal diameters of the fruits, longitudinal diameters of the seeds, equatorial diameters of the fruits, equatorial diameters of the seeds, fruit weights and seed weights of juçara palm fruits were measured, and the deviances, the coefficients of repeatability, the coefficients of determination, and the necessary numbers measurements for an accurate prediction of the real value of the population were estimated. The methods used do not differ as to estimate the repeatability coefficient to the longitudinal diameter characteristics of the fruit, seed equatorial diameter, fruit mass and seed mass. With 95% reliability is possible to use four (4) for mass measurements of fruit and five (5) measurements for longitudinal diameter of fruit, seed equatorial diameter, fruit mass and seed mass.

A juçara é uma planta de ocorrência da Mata Atlântica brasileira e apresenta grande importância ecologia para a biodiversidade e se encontra na lista de espécies ameaçadas de extinção. Os frutos são conhecidos como super frutos por apresentarem características químicas de grande importância. Devido a sua grande importância econômica e pelo baixo número de pesquisas com esta espécie, o primeiro passo é fazer o pré-melhoramento. Este consiste em caracterização morfológica, a qual é muito dispendiosa de tempo e mão de obra. Sendo assim, a diminuição do número de medições avaliadas por indivíduo é de suma importância durante as fases de pré-melhoramento e melhoramento. O objetivo deste trabalho foi obter estimativas dos coeficientes de repetibilidade e de determinação, predizer o número adequado de medições capaz de proporcionar níveis de certeza da predição do valor real dos indivíduos para cada uma das seis características analisadas de Euterpe edulis, e comparar diferentes métodos de estimação da repetibilidade. Foram mensuradas seis características nos frutos de juçara e posteriormente estimou-se a deviance, o coeficiente de repetibilidade, o coeficiente de determinação e o número de medições necessárias para uma predição adequada do valor real dos indivíduos. As metodologias utilizadas não diferem quanto à estimativa do coeficiente de repetibilidade para as características diâmetro longitudinal do fruto, diâmetro equatorial da semente, massa do fruto e massa da semente. Com 95% de confiabilidade é possível utilizar quatro (4) medições para massa do fruto e cinco (5) medições para diâmetro longitudinal do fruto, diâmetro equatorial do fruto, diâmetro longitudinal da semente, diâmetro equatorial da semente e massa da semente.

Adaptabilidade e estabilidade da produção de café beneficiado em Coffea canephora / Adaptability and stability of Coffea canephora coffee bean yield

O objetivo deste trabalho foi comparar a capacidade discriminatória de métodos para seleção e recomendação de clones de cafeeiros da espécie Coffea canephora, considerando a interação genótipos x anos na distribuição da produtividade de café beneficiado, nos períodos de 2000 a 2004 e de 2007 a 2011. O efeito significativo da interação genótipos x anos indicou que existem clones que apresentaram desempenho não consistente ao longo do tempo. Os métodos de LIN & BINNS (1988) e ANNICCHIARICO (1992) apresentaram resultados similares, de modo que um deles pode ser utilizado em substituição ao outro. O método de EBERHART & RUSSEL (1966) identificou parte dos clones de adaptação específica, enquanto que os métodos, MHPRVG e centroide permitiram caracterizar os clones de maior adaptabilidade e estabilidade, apresentando resultados complementares. A seleção de plantas baseada na distribuição da produtividade de café beneficiado ao longo do tempo permitiu selecionar clones de desempenho superior sem acentuar a bienalidade.

This research aimed to compare methods of selecting Coffea canephoraclones, considering the genotypes x years interaction, based on data of processed coffee yield obtained from 2000 to 2004 and 2007 to 2011. The significant clones x seasons (CS) interaction, indicates that the genotypes showed no consistent performance over the years. The LIN & BINNS (1988) and ANNICCHIARICO (1992) methods showed similar results indicating that one method may be used to replace the other. The EBERHART & RUSSEL (1966) identified some of the specific adaptability clones. The MHPRVG and centroid methods allowed to select clones of higher adaptability and stability. The plant selection based on the distribution of coffee productivity over time allowed the selection of superior clones without accentuate biannuality.

Divergência genética de acessos tradicionais de feijoeiros através de características da semente / Genetic divergence of access through traditional bean characteristics of the seed

Este trabalho teve como objetivo avaliar a divergência genética de acessos tradicionais de feijoeiros do Banco Ativo de Germoplasma da Universidade do Estado de Mato Grosso via características das sementes de 65 acessos de feijoeiro do Banco Ativo de Germoplasma de Phaseolus da Unemat, onde a caracterização da semente foi realizada por meio de oito descritores morfológicos qualitativos e cinco descritores quantitativos, submetidos a dois métodos de agrupamento, de Otimização Tocher e Hierárquico UPGMA, comparando seus resultados. Os dados qualitativos apresentaram a formação de seis grupos pelo método de Otimização Tocher e cinco grupos pelo UPGMA, já para as características quantitativas ocorreu a formação de dois grupos pelo método de Tocher e quatro grupos pelo UPGMA, baseado na distância Euclidiana. O estudo possibilitou verificar os acessos mais divergentes e o comportamento dos dois métodos de agrupamento, que demonstraram semelhança no agrupamento dos acessos, possibilitando uma boa visualização da distância genética entre os acessos, tanto para características qualitativas baseado em variáveis multicategóricas quanto para características quantitativas, evidenciando a existência de materiais geneticamente diferentes. O uso conjunto dos dois métodos associados a analises de caracteres qualitativos e quantitativos possibilitou uma avaliação mais precisa dos acessos e em ambos os casos o UPGMA complementou o Tocher.

This study aimed to assess the genetic diversity of traditional bean accesses the Active Germplasm Bank at the University of Mato Grosso via characteristics of seeds of 65 common bean accessions of Active Germplasm Bank of Phaseolus Unemat, where the characterization of the seed foirealizada through eight morphological descriptors qualitative and quantitative descriptors five, subjected to two methods of grouping, Tocher optimization and hierarchical UPGMA, compare their results. The characterization of the seed was performed using qualitative descriptors of eight and five quantitative descriptors. The characterization of the seed was performed using qualitative descriptors of eight and five quantitative descriptors. Qualitative data showed the formation of six groups by Tocher optimization method and five groups by UPGMA, as occurred for the quantitative formation of two groups by Tocher method four groups by UPGMA, based on Euclidean distance. The study enabled us to verify the access and the most divergent behavior of the two clustering methods, which showed similarity in the grouping of accessions, allowing a good view of the genetic distance between accessions for both quality characteristics based on multicategoric variables and for quantitative traits, showing the existence of genetically different materials. The combined use of two methods associated with analysis of qualitative and quantitative characters provided a more accurate assessment of access and in both cases the UPGMA complemented the Tocher.

Aplicação da análise espacial na avaliação de experimentos de seleção de clones de laranjeira Pêra / Application of the spatial analysis on the evaluation of selection experiments of Pera orange tree clones

Em experimentos de competição de cultivares de citros, geralmente são utilizados muitos tratamentos, o que requer o emprego de grandes blocos e parcelas com poucas plantas. Tem sido debatido que, nessas condições, pode ocorrer a correlação entre parcelas vizinhas, violando assim a pressuposição de erros independentes da análise de variância. O presente trabalho teve por objetivo avaliar diferentes parametrizações de modelos, considerando ou não a dependência espacial entre parcelas, em dois experimentos de competição de clones de laranjeira Pêra (Citrus sinensis L. Osbeck). Foi utilizada a estrutura auto-regressiva separável de primeira ordem (AR1 x AR1) como modelo de dependência espacial entre os erros. Os resultados encontrados apontam que a modelagem espacial dos erros utilizando modelos auto-regressivos separáveis de primeira ordem para experimentos de seleção de clones de laranjeira Pêra, normalmente trazem pequenos ganhos em termos de qualidade de ajuste. A análise desconsiderando o fator blocos mais o ajuste espacial auto-regressivo separável de primeira ordem apresentou melhor qualidade de ajuste entre os modelos avaliados.

In competition experiments of citrus cultivations one generally uses many treatments, which requires the use of big blocks and plots with few plants. One has debated that in these conditions there can occur the correlation between neighboring plots, violating, thus, the presupposition of errors independent from the variance analysis. The present work has had as objective to evaluate different model parametrizations, considering or not the spatial dependence between plots, in two competition experiments of Pera orange tree clones (Citrus sinensis L. Osbeck). One has utilized the separable auto-regressive structure of first order (AR1 x AR1) as a model of spatial dependence between the errors. The results found indicate that the spatial modeling of the errors by utilizing separable auto-regressive models of first order for selection experiments of Pera orange tree clones normally bring small gains in terms of quality of adjustment. The analysis not considering the block factor plus the separable auto-regressive spatial adjustment of first order has presented better quality of adjustment between the models evaluated.

Estimates of genetic parameters for physic nut traits based in the germplasm two years evaluation / Estimativa de parâmetros genéticos de caracteres de pinhão-manso em dois anos de avaliação do banco de germoplasma

In spite of increasingly widespread interest in planting physic nut, breeding efforts are still in its infancy. In that context, an important resource recently established aiming future breeding efforts was the assembly of a germplasm bank with near 200 accessions. The objective of this study was to estimate genetic parameters, repeatibility coefficients and genetic correlation between seven traits, measured in 110 accessions (half sib families) of this germplasm bank in different stages of development. The results show that higher relative values of additive variance were only found for yield and height, and the existence of low environmental variation (either of temporary or permanent nature) among plots within blocks. Given the high repeatibility values found for all traits, on average three measurements are necessary to predict, accurately and efficiently, the true breeding value of an individual. Based on the results of genetic correlations, breeding effort should initially be use track trees with increased stem diameter, elevated number of branches and canopy volume so as to increase the chances of finding an exceptionally highly productive tree.

Apesar do crescente interesse no plantio do pinhão manso, os esforços de melhoramento ainda estão em seu início. Nesse contexto, um importante recurso recentemente estabelecido visando a futuros trabalhos de melhoramento foi a montagem de um banco de germoplasma com cerca de 200 acessos. O objetivo deste estudo foi estimar parâmetros genéticos, coeficientes de repetibilidade e correlações genéticas entre sete características, mensuradas em 110 acessos (famílias de meios-irmãos) desse banco de germoplasma em diferentes estágios de desenvolvimento. Os resultados demonstram que valores elevados de variância genética aditiva foram encontrados apenas para produção e altura e a existência de baixa variação ambiental (tanto de natureza temporária quanto permanente) entre parcelas dentro de blocos. Dado os altos valores de repetibilidade encontrados para todas as características, em média três mensurações são necessárias para se predizer, acurada e eficientemente, o real valor de melhoramento de um indivíduo. Baseado nos resultados de correlações genéticas, esforços de melhoramento devem inicialmente ser usados para se identificar árvores de elevado diâmetro de caule, elevado número de ramos e volume de copa, de modo a aumentar as chances de se encontrar árvores excepcionalmente produtivas.

Early selection of full-sib potato families / Seleção precoce de famílias de irmãos-completos de batata

Clonal selection is the preferred breeding method used in potatoes (Solanum tuberosum L.). However this selection procedure is only efficient for more advanced generations and shows no good results when applied in the seedling up to the second clonal generation. This study assessed the feasibility of selection in early generations of full-sib potato families and compares the selection method among and within families with the combined selection under different selection intensities. Six experiments were conducted from the first (C1) until the third clonal generation (C3). In C1 a randomized complete block design with four replications of 25 plants was used. In the remaining generations RCB was employed with three replications of 10 plants. Genetic variances were lower between families than within families, for all traits, but the heritabilities between families were almost always larger. The expected gains from selection between and within families were superior to gains from the combined selection in any intensity of selection. The selection of families should have weaker intensity than selection among clones within families. The selection of families was more efficient when based on the average of environments.

A seleção clonal é o método de melhoramento preferencialmente usado no melhoramento da batata (Solanum tuberosum L.). Contudo, esse método de seleção somente é eficiente em gerações avançadas e não apresenta bons resultados quando aplicado da geração seedling até a segunda geração clonal. Objetivou-se, neste trabalho, verificar a viabilidade da seleção de famílias em gerações precoces e comparar o método de seleção entre e dentro de famílias com a seleção combinada, sob diferentes intensidades de seleção. Seis experimentos foram conduzidos desde a primeira (PGC) até a terceira geração clonal. Na PGC, o delineamento foi DBC com quatro repetições e parcelas de 25 plantas. Nas demais gerações, empregaram-se DBC com três repetições e parcelas de 10 plantas. As variâncias genéticas entre famílias foram menores que dentro de famílias para todas as características, mas as herdabilidades entre famílias foram quase sempre maiores. Os ganhos esperados com a seleção entre e dentro de famílias foram superiores aos ganhos com a seleção combinada, sob qualquer intensidade. A seleção entre famílias deve ter intensidade mais fraca que a seleção entre clones dentro de famílias, sendo ela mais eficiente, quando baseada na média dos ambientes.

Avaliação de linhagens de triticale na região do Alto Paranaíba ­ MG / Evaluation of triticale inbred lines in the region of Alto Paranaíba, state of Minas Gerais, Brazil

O presente trabalho tem por objetivo avaliar novas linhagens de triticale, em dois locais do Estado de Minas Gerais, visando à seleção de novos genótipos para serem multiplicados e distribuídos aos agricultores. Os experimentos foram constituídos de 13 linhagens de triticale e três cultivares de trigo, em delineamento estatístico de blocos ao acaso com três repetiçoes. Foi avaliado o rendimento de grãos e o peso hectolitro. As análises de variância individuais e conjunta demonstraram efeitos significativos de genótipos para as características avaliadas e significativos quando considerado genótipo x local. Todas as linhagens de triticale apresentaram altas produtividades, bem maiores que as obtidas pelas cultivares de trigo. As altas produtividades destas linhagens de triticale demonstram o alto potencial destes genótipos para ser avaliados em futuros ensaios de competição, para o lançamento de futuras cultivares, com destaque, considerando as variáveis avaliadas, para as linhagens EP 068009, EP 068012, EP 068055 e EP 068050, nos dois locais cultivados. O peso do hectolitro das linhagens de triticale foi baixo (média igual a 73,5 kg/hl), o que pode ser explicado pelo comprimento dos grãos e a sua forma, além do fator genético resultante do cruzamento trigo x centeio.

The objective of this work was to evaluate the new breeds lines of triticale in the regions of Minas Gerais state aiming the selection of new germoplasma to be multiplied and distributed among agricultors. The experiments were constituted by 13 lines of triticale and 3 cultivars of wheat ramdomly in block. The grains growth and produce and the yield hectoliter weight, were evaluated. The analizes of individual and group variations presented highly significant variation. All lines presented high productivity, greater than the ones cultivated by wheat. The high productivity of the triticale lines demostrate the material great potential to be analized in future competitional experiments envisioning the future cultivational methods to be launched, outlining the EP 068009, EP 068012, EP 068050 e EP 068055 genotypes in both cultivated ambient. The yield hectoliter weight, of the triticale lines were very low, what can be explained by the grain length and shape, besides the genetic factor as the result of wheat x rye.

Teste de alelismo entre os mutantes de amadurecimento alcobaça e non-ripening em tomateiro / Allelism test between the alcobaça and non-ripening mutants in tomato plants

Desde o início da década de 1980, são relatadas na literatura divergências quanto às relações de alelismo ou não entre os mutantes de amadurecimento de frutos de tomateiro denominados alc (= alcobaça) e nor (=non-ripening). Para dirimir tais dúvidas, foi realizado um teste de alelismo entre os genes considerados. Foram avaliadas 364 plantas F2 provenientes do cruzamento entre as linhagens de tomateiro TOM-559 (alc/alc) e TOM-613 (nor/nor), além de vinte plantas de cada uma das linhagens TOM-559 (alc/alc), TOM-613 (nor/nor), de cada um dos híbridos F1 [(TOM-559 x TOM-613), alc+/alc nor+/nor], F1 [(Floradade x TOM-559), alc+/alc nor+/nor+] e F1 [(Floradade x TOM-613), alc+/alc+nor+/nor], bem como da linhagem de genótipo normal Floradade (alc+/alc+nor+/nor+ rin+/rin+). TOM-559 e TOM-613 são linhagens isogênicas à cv. Floradade, da qual diferem apenas quanto à presença dos genes alc e nor, respectivamente. Frutos de Floradade colhidos no estádio breaker apresentam coloração vermelha normal quando maduros (fenótipo normal), enquanto frutos de TOM-559 ou de TOM-613 permanecem amarelados ou amarelo-alaranjados (fenótipo mutante). De cada planta, foram colhidos quatro frutos no estádio breaker de maturação, que foram avaliadas quanto ao fenótipo (normal ou mutante) quando maduros. Os resultados dos testes de alelismo indicam que a hipótese mais provável é a de que alc e nor sejam alélicos. Dessa maneira, alc é considerado um terceiro alelo no loco nor, e sugere-se a substituição de seu símbolo para norA.

Since the early 1980's there are conflicting reports on the possible allelic relations between the tomato ripening mutants alc (=alcobaça) and nor (=non-ripening). In order to end these controversies, a test of allelism between the genes alc and nor was performed. A total of 364 plants of the F2 population between the tomato lines TOM-559 (alc/alc) and TOM-613 (nor/nor) were screened, along with 20 plants each of lines TOM-559 (alc/alc) and TOM-613 (nor/nor), of hybrids F1 [(TOM-559 x TOM-613), alc+/alc nor+/nor], F1 [(Floradade x TOM-559), alc+/alc nor+/nor+] and F1 [(Floradade x TOM-613), alc+/alc+nor+/nor], and of the normal phenotype line Floradade (alc+/alc+nor+/nor+). TOM-559 and TOM-613 are near-isogenic lines to Floradade, and differ from the latter only due to the presence of genes alc and nor, respectively. Floradade fruit harvested at the breaker stage show normal red color (normal phenotype) when fully ripe, whereas fruit of either TOM-559 or TOM-613 remain yellow or yellowish-orange (mutante phenotype). Four fruits per plant were harvested at the breaker stage and subsequently evaluated for their mature fruit color phenotype (normal or mutant). The results of the test of allelism indicate that the most likely hypothesis is that alc and nor are allelic to each other. Therefore, alc was considered to be a third allele at the nor locus, and the symbol norA was substituted for alc.

Selection in several environments by BLP as an alternative to pooled anova in crop breeding / Seleção em diversos ambientes pelo BLP como alternativa à anava conjunta

Plant breeders often carry out genetic trials in balanced designs. That is not always the case with animal genetic trials. In plant breeding is usual to select progenies tested in several environments by pooled analysis of variance (ANOVA). This procedure is based on the global averages for each family, although genetic values of progenies are better viewed as random effects. Thus, the appropriate form of analysis is more likely to follow the mixed models approach to progeny tests, which became a common practice in animal breeding. Best Linear Unbiased Prediction (BLUP) is not a "method" but a feature of mixed model estimators (predictors) of random effects and may be derived in so many ways that it has the potential of unifying the statistical theory of linear models (Robinson, 1991). When estimates of fixed effects are present is possible to combine information from several different tests by simplifying BLUP, in these situations BLP also has unbiased properties and this lead to BLUP from straightforward heuristics. In this paper some advantages of BLP applied to plant breeding are discussed. Our focus is on how to deal with estimates of progeny means and variances from many environments to work out predictions that have "best" properties (minimum variance linear combinations of progenies' averages). A practical rule for relative weighting is worked out.

Os melhoristas de plantas em geral conduzem testes genéticos em delineamentos balanceados, ao contrário do que ocorre com o melhoramento animal. É possível selecionar progênies pela ANAVA conjunta, com base nas médias gerais de cada família. Sabe-se, no entanto, que os valores genéticos de progênies são melhor representados por efeitos aleatórios. As formas de análise dos testes de progênie que parecem mais apropriadas são as que seguem a metodologia de modelos mistos, como no melhoramento animal. Segundo Robinson (1991) o Melhor Preditor Linear Não-Viesado (do inglês, BLUP) não é um método, mas uma propriedade dos estimadores (preditores) dos efeitos aleatórios e pode ser derivada de tantas maneiras diferentes que tem o potencial de unificar as teorias estatísticas de modelos lineares. A presença de bons estimadores para os efeitos fixos e componentes da variância torna possível combinar informações de diferentes testes por algumas simplificações do BLUP. Este trabalho exemplifica as vantagens do Melhor Preditor Linear (BLP) aplicado ao melhoramento de plantas. Procurou-se ilustrar como proceder com estimativas de médias e de variâncias de progênies obtidas em diferentes ambientes para produzir preditores que tenham propriedades "melhor" (no sentido de variância mínima entre todas as combinações lineares entre as médias de progênies). Derivou-se uma regra prática para a produção dos pesos relativos de cada ambiente. O BLP, em alguns casos, é também não-viesado produzindo BLUPs a partir de lógica mais direta.